Hasta muy recientemente (finales de 2016) ACIPE no contaba con una estructuración definida en función de sus distintas áreas de interés. En la reunión de su última Junta Directiva (Madrid, 15/12/16) se aprobó, por asentimiento, referida estructuración. De esta forma, el organigrama de ACIPE queda así reflejado:
| Área | Responsables |
| Congresos Internacionales | Antonio Valle |
| Revista de Psicología y Educación | Juan Luis Castejón |
| Asociaciones/Sociedades Nacionales e Internacionales | Rosario Ortega |
| Relaciones con: Conferencia de Decanos de Psicología y Consejo General de Colegios Oficiales de Psicólogos | Presidente y Secretario de ACIPE, en cada momento histórico |
| Socios: gestión y formación | Secretario y Tesorero de ACIPE (gestión), Fuensanta Cerezo (formación) |
| Investigación | Ángel de Juanas, Miguel Ángel Huete y Elena Pérez |